Tijela LAG-a su: Skupština, Upravni odbor, Predsjednik, Dopredsjednik i Nadzorni odbor.
Skupština je predstavničko i najviše tijelo upravljanja LAG-a. Skupštinu čine svi redovni članovi.
Predsjednik obavlja izvršne i druge poslove određene Statutom LAG-a, a izvršne funkcije i druge poslove određene ovim Statutom koje obavlja predsjednik u istom obimu ovlašten je obavljati i dopredsjenik po ovlaštenju predsjednika.
Predsjednik LAG-a Južna Istra je g. Predrag Pliško, predstavnik Općine Marčana, a dopredsjednik g. Gordan Trojanović, predstavnik obrta "Rasadnik Darko".
Upravni odbor je koordinativno tijelo LAG-a koje organizira i obavlja tekuće poslove LAG-a, te donosi odluke iz svoje nadležnosti.
Članovi Upravnog odbora jesu:
-
Grad Vodnjan-Dignano, predstavnik: Edi Pastrovicchio
-
Općina Marčana, predstavnik: Predrag Pliško
-
Obrt za proizvodnju bilja Rasadnik Darko, predstavnik: Gordan Trojanović
-
M.G. Express d.o.o., predstavnica: Maria-Gracia Baćac
-
OPG Sanjin Siljan, predstavnik: Sanjin Siljan
-
OPG Predan, predstavnica: Milena Predan
-
Zajednica Talijana Šišan – Sissano, predstavnik: Claudio Grbac
-
Peršić, obrt za poljoprivredu i stočarstvo, predstavnik: Alen Peršić
-
Turistička zajednica Općine Barban, predstavnica: Jelena Lučić Baćac
-
Povijesna udruga Kaštel, predstavnica: Mirjana Brščić Vitasović
-
Udruga umirovljenika Općine Bale, predstavnica: Radana Grujić
-
Društvo osoba sa invaliditetom, predstavnica: Vesna Miletić-Kancelir
-
Općina Fažana-Fasana, predstavnik: Dimitrije Švabić
Nadzorni odbor kontrolira rad LAG-a, ocienjuje izvršenje odredaba Statuta, nadzire zakonitost financijskog i materijalnog poslovanja LAG-a, a u postupku odabira projekata LAG Natječaja je tijelo za prigovore na izdane odluke upravnog odbora.